На думку ряду експертів, що виступили на світовому форумі з питань мікотоксинів, який проводився в Нідерландах, мікотоксини залишаються постійною проблемою для індустрії тваринництва та здоров’я людей, хоча й часто ігнорованою на всесвітньому рівні. В економіці більш багатих країн мікотоксини контролюють чи зводять проблеми, спричинені ними, до мінімуму. Проте в інших частинах світу, як Африка, такий захист відсутній.
Вмісту мікостоксинів у кормі, як правило, недостатньо, щоб викликати явну хворобу. Проте навіть низький рівень токсинів може викликати безліч метаболічних порушень, що призведуть до поганого стану здоров’я тварини. Ці порушення часто важко розпізнати, оскільки клінічні ознаки хвороби часто вказують на інфекцію, а не на токсин, що її спровокував.
Також мова йшла про ген профілювання. В області дослідження мікотоксинів, аналіз експресії генів використовується у з’ясуванні біосинтетичних шляхів окремих мікотоксинів та факторів, які впливають на структуру та кількість мікотоксинів створених одним чи декількома грибковими видами. Аналіз експресії генів може бути хорошим підходом для аналізу ситуації, коли тварини піддаються впливу більш ніж одного мікотоксину в той же самий час.
Були проведені дослідження взаємодій між афлатоксином і охратоксином А, афлатоксином і фумонізіном, фумонізіном андмоніліформіном, афлатоксином і Т2 токсином та охратоксином А і цітрініном. Комбінації мікотоксинів при низькій концентрації окремих видів можуть мати негативний вплив на здоров’я тварин.
Йшла мова і про проблеми боротьби з замаскованими мікотоксинами. Вони привернули до себе увагу ще в кінці 1980-х, тому що в деяких випадках мікотоксикозів, клінічні спостереження у тварин не корелювали з низьким вмістом мікотоксинів у кормах. Через те, несподівану появу високої токсичності пояснили непоміченими, сполученими формами мікотоксинів, які можливо гідролізуються до попередніх токсинів в шлунково-кишечному тракті тварини. То ж різні дослідницькі групи фокусуються тепер на різноманітності замаскованих мікотоксинів, виникненні, біодоступності та токсичності замаскованих форм серед інших.